ISO28000认证内容与AEO认证虽有相似之处，但是ISO认证与AEO认证在认证机构、认证尺度、认证内容等方面均有很大差异。
ISO28000认证是国际标准化组织（International Organization for Standardization）针对供应链安全制定的标准。ISO认证是依据国际标准化组织发布的认证体系标准，由第三方体系认证机构对企业的认证体系实施评定的活动。对合格企业颁发体系认证证书和发布注册名录，向公众证明企业符合某一认证体系标准。
AEO认证（Authorized Economic Operator）是WCO和各国海关组织制定和推行的经过认证的经营者的标准。AEO认证是依据具有法律效力的法律法规及海关规章，由海关官员对企业的认证体系实施评定的活动。对合格企业颁发《认证企业证书》，认证企业适用法律规定赋予的激励措施。
AEO认证是依据海关总署发布的行政法规和部门规章执行，由海关官员进行审查，严格程度较高，通过率较低。并且AEO认证要求企业制度必须符合企业自身经营情况，同时，更加注重企业实际操作对制度的有效落实。因此，ISO认证时提交的资料一方面不能涵盖AEO认证要求的制度和工作记录，另一方面符合ISO认证要求的资料可能并不能达到AEO认证标准，如内审方面的要求。因此，建议贵公司不要完全套用ISO认证时使用的资料，应按照AEO标准准备符合海关认证要求的资料。
另外，根据《中华人民共和国海关企业信用管理办法》及其配套《海关认证企业标准》的要求，AEO认证没有规范改进机会，未通过认证的企业1年内不得再次向海关提出认证申请。而ISO认证对于现场审核中发现的不符合事项，企业可以在规定的时间内进行原因分析，并采取纠正措施。对于纠正措施经审核组验证合格后，连同现场审核记录，审核报告等资料一并提交认证机构技术委员会审查。
因此，贵公司即使已经通过了ISO28000，对AEO认证申请也不可以掉以轻心。贵公司可以借用ISO28000作为良好的基础，按照AEO的标准对企业进行评估，评判企业是否符合AEO一般认证企业的要求。
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